人類外周血單核細胞蛋白質組學研究.pdf

1、蛋白質作為基因表達的產(chǎn)物，生命活動的體現(xiàn)者及功能最終執(zhí)行者，在生物體內有著及其重要的作用。隨著后基因組時代的推進，蛋白質組學的研究逐漸成為近期生物科學研究的中心之一。蛋白質組學的研究不僅能揭示生命活動的基本規(guī)律，也為許多復雜疾病的發(fā)病機理及攻克措施提供了理論依據(jù)。系統(tǒng)而全面性的蛋白質組學研究的主要任務是鑒定和編目在人體某一類細胞或組織中產(chǎn)生的所有蛋白質，然后利用生物信息學的處理方法，例如：實驗獲得的蛋白質數(shù)據(jù)與已建立的數(shù)據(jù)庫進行匹配，蛋

2、白質功能及細胞內分布位點的歸類和分析，與蛋白質相對應的基因功能的注釋(如：基因本體論分析)等，進一步來闡述它們的生物學和細胞學功能，進而幫助更有效的進行某些相關疾病的診斷和治療。系統(tǒng)而全面的呈現(xiàn)蛋白質及其相對應的基因的信息主要包括以下內容：蛋白質的鑒定、定位以及定量分析，蛋白質所對應的基因的功能注釋、歸類等。本研究是針對人類外周血單核細胞(PBM)的蛋白質組學研究。人類外周血單核細胞(PBM)是一種特殊的白細胞，同時也是破骨細胞的前體，

3、它在免疫、血液、骨骼、腫瘤等相關的生理過程中扮演者重要的角色。它涉及到許多人類復雜疾病的生理或病理過程，例如：自身免疫缺陷，HIV，癌癥，骨質疏松等。到目前為止，關于人類PBM的蛋白質組學的研究還十分有限，在蛋白質水平上揭示許多與PBM相關疾病的發(fā)病機理仍有一定的困難，到目前為止，尚未有一個系統(tǒng)編目人類PBM中蛋白質的數(shù)據(jù)庫確立。
　　 本研究中基于76個隨機的不相干的高加索人群，利用現(xiàn)代蛋白質組學研究的最新技術即液相色譜.質譜

4、聯(lián)用技術，獲得76個獨立、有效的PBM蛋白質組學數(shù)據(jù)，我們建立第一個關于人類PBM的蛋白質組學數(shù)據(jù)庫。這個數(shù)據(jù)庫包含了以下信息：鑒定了在PBM中表達的蛋白，這些蛋白的含量以及它們的生化指數(shù)(分子量和等電點)，這些蛋白質的功能(包括細胞器的定位，分子功能及參與的生物學過程)。本研究總共鑒定了2413種在PBM中表達的蛋白。所有這些蛋白對應的基因通過基因本體論(GeneOntology)的分析分別進行了注釋和分類。基因本體論的術語主要分為三

5、個方面：生化過程、細胞組成、分子功能。這些基因被分類到相應的基因本體論術語中。通過這些注釋，能直觀清晰的呈現(xiàn)基因及其表達產(chǎn)物蛋白質與機體生理、生化過程之間關系。在這些注釋中，一些熟知的基因被報道與人類的免疫反應、血液相關生理、骨重建、癌癥等密切相關。
　　 總之，本研究為人類PBM建立了一個全新的蛋白質組學的數(shù)據(jù)庫，這個數(shù)據(jù)庫包含著相對全面而豐富的信息，從整體水平上加深了我們對人類PBM生物學功能的理解。作為第一個針對PBM的蛋