不同地區(qū)自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌多位點序列分型研究.pdf

1、本研究以分離自內蒙古赤峰市、巴彥淖爾市、呼倫貝爾市、錫林郭勒盟和鄂爾多斯市，西藏自治區(qū)、青海省、云南省、四川省、甘肅省和蒙古國的204株乳酸乳球菌為研究對象，應用多位點序列分型技術，通過雙向測序技術獲得dnaA、pyrG、rpoB、groEL、recA、clpX、carB、murC、pepN、pepX、murE和pheS12個持家基因的序列，將其拼接、核對后用BioNumerics v6.0構建等位基因圖譜并確立序列型(STs)，進而對

2、204株乳酸乳球菌進行分型，系統(tǒng)分析菌株間的系統(tǒng)發(fā)育進化關系。結果表明：
　　(1)204株乳酸乳球菌共分為75個STs，分離自相同地區(qū)的乳酸乳球菌分離株大多有著相同的STs。75個STs經過eBURST分析后，共形成13個分型組，28個獨特型。13個分型組中有7個克隆復合體。其中CC26包含乳酸乳球菌分離株最多，被認為是較為原始的CC。
　　(2)通過最小生成樹分析，結果表明204株乳酸乳球菌之間的進化關系，大部分與分離地

3、之間的距離遠近呈現(xiàn)正相關性，分離自不同地區(qū)的菌株可能大部分是由分離自赤峰市的菌株進化而來。另外最小生成樹分析還發(fā)現(xiàn)了兩株被16SrDNA序列分析方法鑒定為Lactococcus lactis subsp. lactis的菌株親緣關系與Lactococcus lactis subsp. cremoris更近。
　　(3)系統(tǒng)發(fā)育分析結果表明，分離自相同地區(qū)發(fā)酵乳中的乳酸乳球菌的STs大部分聚集在同一類群。分離自內蒙古赤峰市的菌株群體

4、分化時間較長，說明分離自不同地區(qū)的204株乳酸乳球菌可能由同一祖先進化而來，而這一祖先菌株可能來源于內蒙古赤峰市。
　　本研究對不同地區(qū)的204株乳酸乳球菌進行多位點序列分型研究，初步建立了一種新的乳酸乳球菌的分型方法，為乳酸乳球菌的MLST數(shù)據(jù)庫提供了豐富的數(shù)據(jù)資料。通過比較各個菌株等位基因序列的差異，初步了解菌株基因序列的進化關系，并分析不同地區(qū)的乳酸乳球菌的遺傳背景，從而推演乳酸乳球菌的進化歷程，為世界范圍內乳酸乳球菌的群體