微生物多糖數(shù)據(jù)庫(kù)的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn).pdf

1、20世紀(jì)90年代誕生的Internet及其隨之而來(lái)的信息高速公路計(jì)劃,意味著信息時(shí)代的到來(lái).幾乎與Internet同時(shí)誕生的人類(lèi)基因組計(jì)劃,是迄今為止耗資最為巨大、競(jìng)爭(zhēng)最為激烈、意義最為深遠(yuǎn)的大型國(guó)際合作研究項(xiàng)目.基因組計(jì)劃和Internet推動(dòng)了生物信息學(xué)的誕生.它以核酸、蛋白質(zhì)、多糖等生物大分子數(shù)據(jù)為主要對(duì)象,以數(shù)學(xué)、信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)為主要手段,以計(jì)算機(jī)硬件、軟件和計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)為主要工具,對(duì)浩如煙海的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲(chǔ)、管理、注釋、加

2、工,使之成為具有明確生物意義的生物信息.與此同時(shí),在傳統(tǒng)的生物學(xué)研究領(lǐng)域,以多糖作為主要研究對(duì)象的一門(mén)學(xué)科糖生物學(xué)也蓬勃興起,并被譽(yù)為生物化學(xué)中最后一個(gè)廣袤前沿.多糖研究工作的開(kāi)展積累了較為豐富的原始數(shù)據(jù),為建立多糖數(shù)據(jù)庫(kù)創(chuàng)造了先決條件,同時(shí),科學(xué)工作者也希望出現(xiàn)有此類(lèi)生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)產(chǎn)生.本文的工作以JSP為平臺(tái),從多糖生物數(shù)據(jù)入手,設(shè)計(jì)了一個(gè)基于瀏覽器/服務(wù)器的三層結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù),將多糖數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中,并通過(guò)Internet與全世

3、界的研究者共享.本文主要在以下幾個(gè)方面進(jìn)行了研究:1.探討了多糖的相關(guān)生物學(xué)信息,包括多糖的結(jié)構(gòu)、命名法,以及微生物脂多糖的生物合成等.2.探討了三層結(jié)構(gòu)的瀏覽器/服務(wù)器模型,并論述了基于Web的應(yīng)用軟件的開(kāi)發(fā)技術(shù).3.詳細(xì)介紹了微生物多糖數(shù)據(jù)庫(kù)的設(shè)計(jì),分析了各種生物信息在數(shù)據(jù)庫(kù)中的存儲(chǔ)方式,為以后建立類(lèi)似數(shù)據(jù)庫(kù)提供參考.本系統(tǒng)經(jīng)過(guò)調(diào)試運(yùn)行基本達(dá)到了實(shí)用要求,能夠?yàn)檠芯空咛峁┒嗵菙?shù)據(jù)信息的查詢(xún)與分析比較服務(wù).本論文以多糖信息的整合、加工