DNA計算基本生物操作模擬.pdf

1、隨著生物技術(shù)的發(fā)展，DNA計算隨之產(chǎn)生。由于DNA計算機所具有的巨大并行性、海量存儲以及低能耗等有點，將有望在某些領(lǐng)域彌補現(xiàn)有計算機的不足。DNA計算是利用DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)和堿基互補配對規(guī)律進行信息編碼，將要運算的對象映射成DNA分子鏈，通過生物酶的作用，生成各種數(shù)據(jù)池，再按照一定的規(guī)則將原始問題的數(shù)據(jù)運算高度并行地映射成DNA分子鏈的可控的生化反應(yīng)過程。最后，利用分子生物技術(shù)(如聚合鏈反應(yīng)PCR、超聲波降解、親和層析、克隆、誘變、分子

2、純化、電泳、磁珠分離等)，檢測所需要的運算結(jié)果。
　　 本文研究主要包括幾個方面的內(nèi)容：DNA計算中基本生物操作的提取、DNA計算中的編碼問題和對DNA計算中基本生物操作的模擬。
　　 DNA計算中基本生物操作的提取是模擬操作實現(xiàn)的前提，只有提煉出基本的生物操作，并且弄清楚這些基本生物操作的實質(zhì)，才能在電子計算機上對其進行準確的模擬。本文主要基于溶液模型提取基本生物操作，這些基本操作可以分為對DNA鏈的操作和對試管的操作

3、。
　　 編碼問題是DNA計算中的關(guān)鍵問題，也是重點和難點問題。本文給出了編碼問題的定義，并且總結(jié)了影響DNA鏈穩(wěn)定性因素。在模擬實驗中綜合考慮了其中部分影響因素，給出的編碼完全滿足實驗要求。
　　 對基本生物操作的模擬是在面向?qū)ο蟮幕A(chǔ)上進行的，文中設(shè)計了三個類TDNAChain、TTube和TControler，分別表示溶液模型中所需要的基本要素：DNA鏈、試管和實驗流程。
　　 最后在這些基本生物操作的基礎(chǔ)