乙型肝炎病毒共價閉合環(huán)狀DNA逆轉錄酶區(qū)準種特性分析及耐藥相關位點變異觀察.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究病毒準種及其耐藥種群的動態(tài)分布,是闡明病毒耐藥和病毒學突破發(fā)生、發(fā)展的關鍵所在。
   本文主要從兩部分進行研究:
   一、未抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內HBVcccDNA和血清HBVDNA逆轉錄酶(reverse transcriptase,RT)區(qū)準種特性的比較分析;
   二、慢性乙型肝炎患者治療前后肝內HBV cccDNA耐藥相關位點變異的觀察。
   第一部分未抗病毒治療的慢性乙型肝炎

2、患者肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準種特性的比較分析
   目的:
   了解未經核苷類似物抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準種的組成情況以及兩者之間的關系。
   方法:
   納入26例未經核苷類似物抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者,留取其肝穿組織和血清,并分別抽提肝組織HBV tDNA和血清HBV DNA;先以不降解質粒的ATP依賴D

3、NA酶(PSAD)酶切純化肝組織HBVtDNA,利用實時熒光定量PCR法定量肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA,根據定量結果,以跨雙缺口引物行巢式聚合酶鏈反應(PCR)擴增HBV cccDNA的RT區(qū),以非跨雙缺口引物行巢式PCR擴增血清HBV DNA的RT區(qū);應用瓊脂糖凝膠電泳回收目的片段,然后對目的片段進行克隆,主要包括重組質粒的構建、小量制備、酶切鑒定,最后對目的片段進行直接測序;根據測序結果,分析肝內HBV cccDN

4、A和血清HBV DNA RT區(qū)準種的組成并比較分析兩者間的關系。
   結果:
   肝內HBV cccDNART區(qū)準種數為4~22,血清HBV DNA RT區(qū)準種數為3~20,肝內HBV cccDNA RT區(qū)和血清HBV RT區(qū)兩者的準種數差異尚無統(tǒng)計學意義(p>0.05);肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)優(yōu)勢準種核苷酸序列部分(5/26例)一致,部分(21/26例)不一致;肝內HBV cccDNA

5、和血清HBV DNA RT區(qū)準種復雜度在核苷酸水平和氨基酸水平的差異均無統(tǒng)計學意義(p>0.05);肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準種多樣性在核苷酸水平和氨基酸水平的差異均無統(tǒng)計學差異(p>0.05)。
   結論:
   1、證實了肝內HBV cccDNA準種的存在。
   2.在未經抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準種數量差異無統(tǒng)計學意義;

6、肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)優(yōu)勢準種不完全一致;兩者準種復雜度和多樣性之間差異無統(tǒng)計學意義。
   第二部分慢性乙型肝炎患者治療前后肝內HBV cccDNA耐藥相關位點變異的觀察
   目的:
   了解慢性乙型肝炎患者肝內HBV cccDNA耐藥相關位點自然變異的發(fā)生情況及抗病毒治療前后,肝內HBV cccDNA耐藥相關變異位點野生型與變異型所占比例變化情況。
   方法:

7、>   納入了13例間隔約12月先后兩次肝穿的慢性乙型肝炎患者,抽提冰凍肝組織獲得HBV DNA抽提液,通過酶切純化、熒光定量PCR法定量肝內HBV cccDNA和血清HBV DNA;應用PCR、巢式PCR和直接測序法檢測治療前后肝內HBV cccDNA耐藥相關位點變異;對肝內HBV cccDNA的RT區(qū)克隆測序分析。
   結果:
   發(fā)現(xiàn)3例(3/13)存在肝內HBV cccDNA耐藥相關位點自然變異;發(fā)現(xiàn)1例(

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