中國西南馬mtDNA序列進化與群體遺傳結構分析.pdf

1、本研究從中國貴州黔西南州冊亨縣、廣西百色德保地區(qū)、云南丘北縣、大理、文山州和陜西寧強地區(qū)等省、市地區(qū)采集了貴州馬(GZ，30匹)、德保馬(DB，34匹)、丘北馬(YN，30匹)、文山馬(WS，18匹)、大理馬(DL，10匹)、寧強馬(NQ，20匹)、建昌馬(LC，2匹)七個西南馬品種，并在山東濟南動物園采集到了外來純種設特蘭矮馬(ST，3匹)作為對照。共計147個馬品種的樣品，基于PCR-SSCP和DNA測序技術，利用自行設計的3對引物

2、(MT2、MT3、MT5)和參照Stephen Paul Harrison等(2006)[50]的兩對引物(MT1、MT4)對以上馬品種線粒體DNA編碼區(qū)進行多態(tài)性分析，從而進一步探討了群體內和群體間的mtDNA的遺傳變異，目的是為了西南馬遺傳資源的合理利用及保護提供科學的依據。研究結果如下: 1.五對引物中，只有三對引物擴增片段出現多態(tài)性。MT2、MT4多態(tài)位點上存在兩種單倍型(即A和B)，而且B單倍型出現頻率均高于A單倍型；

3、在MT3位點上，共檢測到四種單倍型，其中A單倍型占優(yōu)勢。 2.所測序的線粒體ND4和ND4L基因的部分核苷酸序列平均GC含量在74.3％～47.1％之間，核苷酸組成偏倚不嚴重，但密碼子使用存在偏倚。 3.西南馬品種內核苷酸多樣性(Pi)較高(0.00467～0.00737)，其中大理馬的核苷酸多樣性(Pi)最低，為0.00467，貴州馬、德保馬、文山馬和寧強馬均為0.00649，丘北馬最高，為0.00737。各品種間的遺