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文檔簡介
1、硼是植物生長發(fā)育必需的微量元素之一。然而植物對硼元素的濃度適應范圍比較窄,硼濃度過低容易導致樹勢早衰,硼過高則會引起葉片早落現(xiàn)象。柑橘產(chǎn)區(qū)的硼缺乏現(xiàn)象普遍存在,增施硼肥不當易發(fā)生毒害現(xiàn)象,這都嚴重影響了柑橘的生長發(fā)育。近期研究表明,植物中的水通道蛋白MIP家族參與了硼元素的吸收和運輸過程,因此分析柑橘MIP家族基因在硼逆境條件下的轉錄水平,將有助于理解柑橘植株適應硼逆境的分子機制。本研究以最常用的柑橘砧木枳[Poncirus trifo
2、liata(L.)RAF.]為材料,克隆得到18個MIP基因家族成員的序列,包括10個PIPs和8個TIPs亞家族成員。本研究主要內容包括:
?、臥trPIPs和Ptr TIPs成員的生物信息學分析:克隆結果表明,PtrPIPs和Ptr TIPs成員的片段長度在750 bp~1500 bp范圍之間,以1000 bp左右者居多;在系統(tǒng)進化樹分析表明,PtrPIPs和Ptr TIPs亞族成員與其他物種PtrMIPs的5個亞族成員分別
3、位于不同的5個分支上,彼此間同源關系較近,其中PtrPIPs亞族又分成兩個不同的亞組,分別位于下一級分支上;序列比對發(fā)現(xiàn),PtrPIPs和Ptr TIPs亞族成員具有水通道蛋白特有的NPA(Asn-Pro-Ala)特征基序和特征信號序列(-SGGHINPAVTFG);保守氨基酸位點分析發(fā)現(xiàn),PtrPIPs和PrTIPs亞族成員具有各自特有的氨基酸保守位點;組織表達分析顯示,PrPIPs和Pr TIPs大多在根中表達,部分在莖、葉中表達,
4、少數(shù)成員在不同組織中均表達;其中強調的是,PtrTIP5;1主要在莖中表達,而PtrPIP2;4和PtrPIP2;7主要在葉中表達。
?、婆鹈{迫下PtrPIPs和Ptr TIPs成員的時空表達模式:在缺硼/硼毒害處理下,根中響應的成員主要是PtrTIPs,葉中響應的主要成員是PtrPIPs,而莖中兩個亞族不分上下;不同硼處理下在根中均上調表達的成員個數(shù)為7個,均下調表達成員個數(shù)為6個;其中,缺硼處理下響應激烈的成員依次為PtrT
5、IP4;1> PtrTIP5;1> PtrPIP2;7,硼毒害處理下響應激烈的成員依次為PtrTIP4;1> PtrPIP2;7>PtrTIP1;3;不同硼處理下在莖中均上調表達的成員個數(shù)為8個,均下調表達的成員個數(shù)為10個;其中,缺硼處理下響應激烈的成員依次為PtrTIP4;1>PtrPIP2;7>PtrTIP1;3,硼毒害處理下響應激烈的成員依次為PtrPIP2;7>PtrTIP4;1>PtrTIP1;3;不同脅迫下在葉中均上調表達
6、的成員個數(shù)為10個,均下調表達的成員個數(shù)為6個;其中,缺硼處理下響應激烈的成員依次為PtrPIP2;6>PtrPIP2;4>PtrTIP1;3>PtrTIP5;1,硼毒害處理下響應激烈的成員依次為PtrPIP2;6>PtrPIP2;4>PtrTIP1;3>PtrPIP2;2;此外,PtrPIP1;1、PtrPIP1;2、PtrPIP2;1和PtrTIP3;2在根、莖及葉中均下調表達,而PtrPIP2;7和PtrTIP4;1在根、莖及葉中
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