超級雜交稻兩優(yōu)培九EREBP cDNA的生物信息學分析與克隆.pdf

1、超級雜交稻是在我國種植面積極廣的一種糧食作物，目前我國的超級雜交稻在超高產(chǎn)育種領域已取得了令世界矚目的成就。乙烯反應元件結合蛋白與植物生長發(fā)育、抗病和抗逆性等一些重要生理生化反應的基因調控有著密切的關系，近年來已成為研究的熱點，并取得了一定進展。生物信息學結合分子生物學、遺傳學等生物技術手段，為研究乙烯反應元件結合蛋白提供了幫助。 本研究以生物信息學的分析為基礎，利用模式植物擬南芥中編碼乙烯反應元件結合蛋白的cDNA，對現(xiàn)有的水

2、稻基因組數(shù)據(jù)庫進行搜索，獲得一條高同源的未知序列。通過對這條未知序列的核酸序列和蛋白質序列、結構、性質、功能等方面的一系列生物信息學分析，表明未知序列應為水稻中編碼乙烯反應元件結合蛋白的eDNA。以超級雜交稻為材料，提取總RNA并反轉錄成eDNA，用未知序列設計一對簡并引物，經(jīng)PCR擴增出編碼乙烯反應元件結合蛋白的eDNA片段，eDNA片段經(jīng)T-A克隆后進行測序，獲得一條長915bp的eDNA片段，BLAST表明未知序列的部分核酸序列與