雞含錳超氧化物歧化酶cDNA克隆與全序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、該研究查明并報道了以往文獻(xiàn)中尚未見報道的雞MnSODcDNA全序列.首先根據(jù)已知雞MnSOD的N端氨基酸序列設(shè)計(jì)簡并引物,應(yīng)用3′RACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)技術(shù),擴(kuò)增克隆了雞心肌MnSOD的3′cDNA區(qū)段.測序結(jié)果表明:該3′RACE片段長1027bp,涵蓋了雞MnSODcDNA的絕大部分成熟肽編碼區(qū)及其完整的3′非翻譯區(qū),其中編碼區(qū)597bp,編碼193個氨基酸殘基,完整的3′非翻譯區(qū)長41

2、1bp,在poly(A)尾上游-29bp處有一AATAAA加尾信號.然后根據(jù)3′RACE片段測序結(jié)果設(shè)計(jì)此物應(yīng)用5′RACE技術(shù),擴(kuò)增克隆了雞心肌MnSOD的5′cDNA區(qū)段,并對其進(jìn)行了克隆測序.測序結(jié)果表明:5′RACE片段長521bp,涵蓋了雞MnSODcDNA的信號肽編碼區(qū)和部分N端成熟肽編碼區(qū)及其完整的5′非翻譯區(qū),且與3′RACE片段有352bp的重疊區(qū).進(jìn)而對3′RACE片段和5′RACE片段序列信息進(jìn)行拼接,從而最終獲取

3、雞MnSODcDNA的全序列信息.最終結(jié)果表明:雞MnSODcDNA全長為1108bp,其中5′非翻譯區(qū)25bp,編碼區(qū)675bp,3′非翻譯區(qū)408bp,編碼一個長224個氨基酸殘基的蛋白質(zhì)前體.其中信號肽長26個氨基酸殘基,成熟肽長198個氨基酸殘基.雞MnSOD推導(dǎo)氨基酸序列與人、大鼠、線蟲C.elegans、果蠅D.melanogaster、嗜熱枉熱菌T.thermophilus等生物MnSOD氨基酸序列的同源性分別為82.4﹪

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