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文檔簡介
1、PLIN1基因編碼的脂滴包被蛋白是脂滴表面含量最豐富的蛋白,是調控脂類代謝的“分子開關”。脂肪沉積性狀是判定豬肉質優(yōu)劣的重要指標,目前關于PLIN1基因的研究多集中于人類脂代謝綜合征上,有關豬PLIN1基因的報道較少。開展PLIN1基因與豬脂肪性狀的相關性研究,并進一步在形態(tài)學基礎上對所得結果進行分析,可拓展豬脂肪沉積機理的研究范圍,為推動豬脂肪沉積機理的早日揭示打下基礎。
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2、用常規(guī)方法測定背膘厚、肌內脂肪含量、大理石花紋、剪切力等脂肪沉積相關性狀并采集樣品。運用PCR-SSCP法對豬PLIN1基因第2、4外顯子進行SN-P篩查,采用一般線性模型分析所得基因型對脂肪沉積性狀的影響作用。運用組織形態(tài)學分析方法進一步對PLIN1基因多態(tài)與脂肪性狀的相關性結果進行分析。運用多種生物信息學分析工具分析和預測豬PLIN1基因及其蛋白物種間的同源性及結構、功能。
結果顯示,在豬PLIN1基因第2、4外顯子分
3、別發(fā)現(xiàn)一處堿基替換突變。第2外顯子的AA型背膘厚極顯著高于AB和BB型(P<0.01),而AA型剪切力值極顯著低于AB型和BB型(P<0.01);第4外顯子的CD型背膘厚顯著高于CC型(P<0.05),CD型肌內脂肪含量極顯著高于CC型(P<0.01)。進行冰凍切片及數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)脂肪面積百分數(shù)與肌內脂肪含量、大理石花紋呈正相關(P<0.05),肌內脂肪含量與大理石花紋呈正相關(P<0.01);脂肪面積百分數(shù)與肌內脂肪含量回歸關系顯著,呈
4、二次方關系;PLIN1AA型和AB型脂肪面積百分數(shù)比BB型高,CD型比CC型高。生物信息學結果分析顯示豬PLIN1基因與馬、牛、綿羊、人、黑猩猩、狨、鴨嘴獸、小鼠、雞的同源性達到89%、88%、87%、86%、86%、85%、82%、82%、77%;豬PLIN1蛋白含有多個磷酸化位點,并且含有多個疏水區(qū);密碼子偏愛性分析發(fā)現(xiàn)第2、4外顯子突變導致了PLIN1基因選擇使用頻率不同的密碼子。
結果表明,豬PLIN1基因第2、4
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