奶牛瘤胃微生物元基因組文庫中脲酶和脂肪酶克隆的篩選與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究從奶牛瘤胃微生物中篩選得到了脲酶和脂肪酶陽性克隆,對其酶學性質(zhì)進行分析,并勾畫了尿素分解菌多樣性,共包括三個部分: 第一部分:利用脲酶選擇性培養(yǎng)基,從奶牛瘤胃微生物BAC文庫的15360個克隆中篩選得到了16個脲酶克隆。利用酚-次氯酸法對脲酶克隆的酶活性分析,表明均具有不同的尿素分解能力,酶的活力范圍是30~2466 U/mg。脲酶陽性克隆插入片段大約是60 kb,限制性內(nèi)切酶HindⅢ酶切圖譜表明,各個克隆具有不同DNA

2、片段,其中脲酶U1、U3、U4和U9的最適pH為8.0,最適溫度為60℃。 第二部分:提取16個脲酶克隆的質(zhì)粒,利用脲酶保守序列ureC引物和細菌16SrDNA通用引物進行PCR擴增,將PCR產(chǎn)物連接到pMD19-T載體,轉(zhuǎn)化E.coli JM109,挑取陽性克隆測序。利用Blast程序?qū)⑿蛄信cGenBank和RDP數(shù)據(jù)庫進行比對,并使用Mega4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。4個脲酶克隆含有脲酶保守序列ureC,系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明,

3、U1、U5、U13和U15分別屬于Firmicutes,ε-Proteobacteria,β-Proteobacteria和Actinobacteria;7個脲酶克隆含有16S rDNA,經(jīng)過系統(tǒng)發(fā)育分析,U1、U3、U7、U10、U11、U12和U14分別屬于Staphylococcus,Shigella,Bacillus,Acinetobacter,Achromobacter,未培養(yǎng)微生物和Bacillus。本研究表明奶牛瘤胃微生物

4、脲酶基因和尿素分解菌具有多樣性的特點。 第三部分:利用含有三油酸甘油酯的脂肪酶選擇性篩選培養(yǎng)基,從奶牛瘤胃微生物元基因組文庫15360個克隆中,篩選得到了18個脂肪酶陽性克隆,其插入片段大約為60 kb,并且各個克隆的插入片段各不一樣。利用p-NPP法對脂肪酶克隆的脂肪酶活性分析,表明均具有大小不等的脂肪酶活性。底物特異性分析表明Lipase6、Lipase7和Lipase8分別對C16底物(對硝基苯棕櫚酸酯)、C12底物(對硝

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