五種野生稻中包含Pi2-9遺傳座位的BAC克隆的篩選與序列初步分析.pdf

1、在水稻Ⅵ號(hào)染色體著絲粒區(qū)域的Pi2/9遺傳座位中至少包含五個(gè)稻瘟病抗性基因：Pi2，Pi9，Piz-t，Piz，Pigm。它們都來(lái)自不同供體。其中已克隆到的三個(gè)基因：Pi2，Pi9，Piz-t編碼序列高度同源的NBS-LRR蛋白，對(duì)稻瘟病菌都顯示出了極強(qiáng)的廣譜抗性。 為初步分析該遺傳座位在AA基因型野生稻(Oryza nivara Oryza rufipogon)中的分布情況，本文使用同源搜索的方法從上述野生稻BES數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得

2、了三個(gè)候選克隆，應(yīng)用雜交方法對(duì)它們進(jìn)行了鑒定。發(fā)現(xiàn)它們的序列高度同源，其中OR_BBa0100819的長(zhǎng)度最長(zhǎng)。 初步分析已經(jīng)獲得的BBCC基因型野生稻(Oryza，minuta)中可能包含Pf2/9遺傳座位的BAC克隆OM_Ba030A22和OM_Ba0045A15的序列后，發(fā)現(xiàn)OM_Ba030A22只含有Pi2/9遺傳座位的同源序列，并未覆蓋該遺傳座位，OM_Ba045A15部分覆蓋了該遺傳座位。使用同源搜索的方法獲得了OM

3、_Ba045A15可能的延伸克隆OM_Ba0024C01，進(jìn)一步的雜交鑒定發(fā)現(xiàn)二者并不具有重疊區(qū)域。 使用鳥(niǎo)槍法測(cè)定了OR_BBa0100819和OM_Ba0024C01的序列，分析發(fā)現(xiàn)OM_Ba0024C01也覆蓋了部分Pi2/9遺傳座位。使用同源搜索的方法獲得了它的延伸克隆OM_Ba0103F07，進(jìn)一步分析后發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)BAC克隆仍未完全覆蓋Oryza minuta中的Pi2/9遺傳座位。 本文還初步分析了已經(jīng)完全測(cè)